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楼主: 青龙偃月刀

关于纳米抗体的读文献笔记

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 楼主| 发表于 2022-2-21 07:32:50 | 显示全部楼层
本帖最后由 青龙偃月刀 于 2022-2-21 19:26 编辑

构象选择性纳米抗体还可以靶向非GPCR的抗原,如蛋白酶和整合膜蛋白受体。如,Kromann Hansen等人发现了两个针对尿激酶型纤溶酶原激活物(uPA)的纳米抗体,其中一个纳米抗体是竞争性活性位点抑制剂,另一个VHH是变构调节剂。生物物理测量结合VHH共络合x射线结构有助于理解反平行到平行构象之间的平衡。

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 楼主| 发表于 2022-2-21 19:31:36 | 显示全部楼层
构象特异性纳米抗体不仅提高了我们对GPCR生物学的认识,而且进一步加深了我们对整体膜蛋白受体生物学的认识。有助于理解靶蛋白在激活状态下的分子状态,及允许使用纳米抗体锁住药物构象中的受体,促进新药物的发现。
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 楼主| 发表于 2022-2-21 19:37:57 | 显示全部楼层
本帖最后由 青龙偃月刀 于 2022-2-21 20:26 编辑

与靶抗原ph依赖性结合的抗体的工程化改造如筛选与中性ph相比在酸性ph下表现出降低的抗原结合的抗体。
抗体可以是经工程化的以在中性ph(例如ph7.4)下保持高亲和力抗原结合,并且在酸性ph(例如ph4.5至6.0)下显示出降低的结合。
促进增强抗原清除,可使得能够进行更低频率地或更低地抗体给药。
通常,ph依赖性抗体-抗原结合依赖于可电离的组氨酸残基的存在,将组氨酸突变随机引入到纳米抗体库的互补决定区(complementary-determiningregion,cdr)中。

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 楼主| 发表于 2022-5-2 20:37:10 | 显示全部楼层
具有抗原特异性的纳米抗体具有广泛的应用前景。到目前为止,筛选得到的纳米抗体主要来源于免疫库。
纳米抗体最直接的应用是用于蛋白质纯化和识别。
如抗gfp或者抗yfp纳米抗体固定在琼脂糖树脂上,可用于纯化来自哺乳动物细胞裂解液中和GFP或者YFP融合的低表达蛋白
抗原特异性纳米抗体和碱性磷酸酶或辣根过氧化物酶偶联后,可以用于酶联免疫吸附试验,已成功应用于病毒检测和毒性物质检测。
用合成库筛选得到的抗PA的纳米抗体,可以固定在96孔板上,建立了PA-ELISA检测系统捕捉PA。
该系统可检测50-1000 ng / mL的PA抗原。

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 楼主| 发表于 2022-5-2 20:59:05 | 显示全部楼层
本帖最后由 青龙偃月刀 于 2022-5-2 21:06 编辑

纳米抗体可以用于结构分析:
对于处于高度动态的蛋白质,如淀粉样蛋白和一些膜蛋白的结构比较复杂,这些结构在未能达到动态平衡时很难判定。
Nb和抗原结合时能减少抗原的流动性,将其固定在一个优化的状态。构象特异性纳米抗体不仅提高了我们对G蛋白偶联受体GPCR生物学的认识,而且进一步加深了我们对整体膜蛋白受体生物学的认识。有助于理解靶蛋白在激活状态下的分子状态,及允许使用纳米抗体锁住药物构象中的受体,促进新药物的发现。
2018年以前,所有靶向GPCR的纳米抗体均来自免疫文库。由于合成纳米体库的广泛适用性,目前已经建立了几个库用于构象特异性纳米抗体的筛选。
到目前为止,有超过150种纳米抗体--抗原的共结晶结构上传至wwPDB数据库。
随着越来越多的研究使用合成纳米体库,相信在不久的将来,将探秘出更多的共结晶结构。

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 楼主| 发表于 2022-5-2 23:58:58 | 显示全部楼层
纳米体除了在体外使用外,细胞内表达纳米抗体可以有很多应用。
第一个好用的工具是将纳米抗体与荧光蛋白融合,从而生成自带细胞内荧光、识别抗原的纳米抗体。这种荧光抗体可以在活细胞中表达,用于识别和追踪抗原。它们已经成功地用于定位细胞间隔,如细胞骨架肌动蛋白丝和组蛋白染色质标记。
胞内纳米抗体还可用于超分辨率成像。超分辨率显微镜总是需要光稳定性标记,而在广泛的图像采集过程中,荧光纳米抗体遭受光后荧光容易淬灭。将纳米抗体与有机染料结合,可发展成为超分辨显微镜中极具吸引力的探针。


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 楼主| 发表于 2022-5-3 22:34:27 | 显示全部楼层
胞内纳米抗体可以用作蛋白质敲除工具。
如开发了deGradFP方法,可以通用于监测活细胞中蛋白质敲除。
将抗GFP的纳米抗体基因与一个果蝇的F-box结构域进行融合。
在真核细胞中,纳米抗体与和GFP融合的抗原结合,抗原多泛素化后,通过泛素耗尽通路以降解和GFP融合靶点蛋白,该技术被用于降解转录因子和参与转基因果蝇形态发育的相关蛋白。

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